クラッチのほうは大丈夫ですか？よく発進する時に車体がガクンと揺れるのが
アクセルで加速する前にクラッチペダルを上げてしまうのが原因かと思われます。
クラッチはよく膝で操作調節をするように教わると思います。教習車でも、
車によって半クラッチの位置が微妙に違いますから、半クラッチの位置を
早く掴んでその位置を固定することができれば、ほんの僅かの動力でも
車は動きます。あまりアクセルを踏み過ぎますと急発進になりますから
気をつけてくださいね。

まずアクセルを踏む時はゆっくり踏んで下さい。それとアクセルを
踏み過ぎた時も、踏む時と同じくらいゆっくり緩めるましょう。
kinさんのおっしゃる踵を固定して、つま先でアクセルを踏むも
良いと思います。初めのうちはアクセルを踏んだときに、
予定していた回転をオーバーする事もありますが、
もう少し乗れば大丈夫だと思います。焦らずじっくりやりましょう！(^O^)

クランクなどの狭路はクラッチ操作次第でできるはずです。
焦らずに頑張ってください。

近すぎると脚のパワーがペダルの反発力に勝ってしまうのでガクガクとした操作になると思います。シート位置は指導員によって少し意見が異なるところだと実感しましたが、私自身はある指導員が足を投げ出すように調整しているのを見て、それをまねてからクラッチ操作がスムーズになりました。シートの位置をいろいろ試してみてはいかがでしょうか。