本籍と住所ですが・・・勘違いをされているみたいなので・・・
本籍はご自身の戸籍謄本（抄本）の住所です。
住所はご自身の現在の住まいのある住所です。
私は父の里である「広島県」が本籍ですが・・・

ご家族が別々というのは、別居されているだけでは？
ご結婚をされて、世帯を持った場合であれば新たに戸籍を作るので新しい本籍になりますが・・・
ご参考までに・・・