何を根拠に「男がＡＴ限定ではかっこわるい」と思われているのでしょうか？
何も恥じることはありません。ＡＴでもＭＴでも車を操作するには変わりありません。
しいて言えば、ＡＴはギアのことを意識せず、運転に集中出来る特性があります。
ちなみに私は「ＡＴ限定」で運転免許を取得しました。
ＭＴ車に乗りたければ「限定解除」をすれば乗れます。

＞やっぱり就職する上ではMTのほうがいいのですか？
根拠は何ですか？？ご自身の質問は「オレはこう思うけどどうなの？？」というのが一切ないですね。
これから就職されるのであれば、自分の意見を述べることが大事ですよ！！

会社の車が仕事上で必須なら、ＭＴ車で取るべきだと思います。
しかしながら･･･運送業でもやらない限り、ＡＴで十分です。