二輪車(原付)と乗用車(教習車)では、運転する際の視点(周りの見え方)が大きく異なっているので無意味だと思いますが、先に原付免許を取得するのは良いかもしれません。免許年月日の二輪・小特・原付の欄に日付が記載されますし、公的な身分証明書にもなります。そういった意味でデメリットよりもメリットの方が多いですね。
AT車の教習は決して簡単ではありません。クラッチ操作と加速時のギアチェンジだけを機械(オートマチックトランスミッション)に任せているので、ハンドル操作や車両感覚などを身に付けなければならない点ではMT車と変わりません。
何故ご自身が思っている様に教習を進められないのか?原因があるから今の結果に至っているのではないですか?その原因を探ってみて、弱点を克服する様努められた方が宜しいかと存じます。