あなたが補修を恐れている時点で、潔く教習自体をお辞めになった方がいいんじゃないかと正直思いました。第一段階の技能はMT車なら15時限、AT車なら12時限ですが、これはあくまでも最低時限数ですので、この時限数を越えてはいけないというワケではありません。殆どの場合、この時限数を越えている方々が多いですし、オーバーしたら恥ずかしいなど考えるのは大きな間違いです。
時速40kmは、道路に出れば逆に遅く感じます。今は所内のコースなので速く感じている筈ですが、速度感覚は慣れですので然程懸念される必要はありません。
補修が付いても、他の教習生や指導員・職員から何か言われる事はないですし、ご自身のネガティブな考え方を改めれば解決する問題だと思いますが如何でしょう?